Отделение открыто в 1994 году. Специализируется на оказании высокотехнологичной специализированной урологической помощи, с использованием новейших достижений отечественной и мировой урологии, выполняются все виды ультразвуковой, эндоскопической и рентгенологической диагностики урологических заболеваний. Является одним из ведущих в России подобных структур. 

Также отделение занимается лечением следующих гинекологических патологий:
Доброкачественные опухоли матки;
Доброкачественные опухоли придатков;
Эндометриоз матки и придатков;
Аденоматоз, атипическая гиперплазия эндометрия;
Патология эндометрия;
Выпадение матки, опущение стенок влагалища;
Элонгация, выпадение шейки матки;
Доброкачественные образования влагалища.

Оперативное вмешательство выполняется в течение 1 месяца с момента обращения. Отбор пациентов на оперативные вмешательства осуществляется в поликлинике госпиталя.

Отделение урологии рассчитано на 35 коек, ежегодно выполняется более 800 операций и различных хирургических манипуляций жителям Екатеринбурга, Свердловской области и других регионов России.

В отделении ведётся научно-исследовательская работа, защищены две кандидатские и одна докторская диссертации. Получены два патента на изобретение.

Основное направление эндоскопическая и малоинвазивная урология, что совместно с опытом и знаниями персонала позволяет помогать пациентам преклонного возраста с выраженной сопутствующей патологией.В работе отделения используется самое современное оборудование (эндоскопическая и лапароскопическая стойка STORZ, в том числе ультразвуковой и пневматический литотриптор, комплексная уродинамическая система LABORY, ультразвуковой сканер SIMENS, высококачественные расходные материалы.